Trabajo Original
Identificación de variantes genéticas asociadas con la densidad mineral ósea (DMO) en el gen FLJ42280
Roca-Ayats N, Cozar Morillo M, Gerousi M, Czwan E, Urreizti R, Martínez-Gil N, García-Giralt N, Mellibovsky L, Nogués X, Díez-Pérez A, Balcells S, Grinberg D
FLJ42280 es un posible gen de susceptibilidad a la osteoporosis. Distintos estudios de GWAs han identificado 4 SNPs no-codificantes en este gen que se asocian a la densidad mineral ósea (DMO) y el riesgo de fractura.
Para descubrir la causa de la asociación entre estos SNPs y la osteoporosis, se realizó una búsqueda de variantes genéticas mediante resecuenciación de 28 kb que contienen el gen, en una selección truncada de mujeres con DMO muy baja (n=50) o muy alta (n=50) de la cohorte BARCOS (Barcelona Cohorte Osteoporosis, cohorte de mujeres postmenopáusicas de Barcelona). Las variantes encontradas se filtraron y se analizó su frecuencia en cada grupo. Se analizó el solapamiento de las variantes con elementos funcionales del proyecto ENCODE y también se calculó el desequilibrio de ligamiento entre los SNPs de la región. Finalmente, se hizo un análisis de eQTL de los 4 SNPs no-codificantes respecto a los niveles de expresión de genes cercanos a FLJ42280 en linfoblastos.
Se seleccionaron 110 variantes. Las diferencias de sus frecuencias entre los dos grupos estuvieron por debajo del poder estadístico del diseño experimental. Sin embargo, 3 variantes solaparon con posibles enhancers y una solapó con un enhancer activo en osteoblastos (rs4613908). Se observó un fuerte desequilibrio de ligamiento entre los 4 SNPs no-codificantes y el SNP rs4613908, que pertenecen a un bloque que abarca el gen casi por completo. Ninguno de los SNPs no-codificantes mostró asociación con los niveles de expresión de genes cercanos a FLJ42280.
En conclusión, el SNP rs4613908 podría estar implicado funcionalmente en la determinación de la DMO. Serán necesarios experimentos concretos para confirmarlo.
Palabras Clave: FLJ42280, densidad mineral ósea, variantes genéticas, eQTLs, enhancers.
Artículos Relacionados:
Trabajo Original:
Cambios en la masa ósea en una población infantil con diabetes mellitus tipo 1. Estudio longitudinal
Trabajo Original:
Efecto del tratamiento con denosumab durante 24 meses en individuos con lesión medular reciente con osteoporosis
Trabajo Original:
Asociación de parámetros bioquímicos del metabolismo óseo con progresión y/o desarrollo de nuevas calcificaciones aórticas
Trabajo Original:
Búsqueda de variantes del gen LRP4 en mujeres con alta masa ósea y en pacientes con malformación de Chiari tipo I
Trabajo Original:
Efectos del tratamiento con bazedoxifeno sobre la calidad ósea en ratas ovariectomizadas
Trabajo Original:
¿Pueden las mediciones 3D derivadas de la DXA lumbar predecir fracturas en las vértebras dorsales?
Trabajo Original:
Efectos del calcio y la vitamina D con y sin lactulosa en la densidad mineral ósea de mujeres postmenopáusicas con osteopenia: Ensayo piloto controlado y aleatorizado
Trabajo Original:
La variante missense rs2908004 de WNT16 actúa como eQTL de FAM3C en osteoblastos primarios humanos
Trabajo Original:
Niveles de calcidiol y mantenimiento de la función muscular, capacidad funcional y densidad mineral ósea en población española no seleccionada
Editorial:
Fracturas femorales atípicas: una rara complicación posiblemente debida a la acumulación de variantes genéticas raras
Trabajo Original:
Influencia de la obesidad sobre la microarquitectura y las propiedades biomecánicas en pacientes con fractura de cadera
Trabajo Original:
Análisis genético de enzimas de la vía esteroidal asociadas a efectos adversos musculoesqueléticos delos inhibidores de la aromatasa
Revisión:
Hormonas tiroideas, TSH, cáncer de tiroides y hueso en mujeres pre y postmenopáusicas
Trabajo Original:
Influencia de la vitamina D sobre la microestructura y propiedades biomecánicas de pacientes con fractura de cadera
Trabajo Original:
Comparación de los valores densitométricos de la extremidad proximal del fémur en sujetos jóvenes sanos: zurdos vs. diestros
Trabajo Original:
Predictores del riesgo de fractura en una población de mujeres postmenopáusicas mediante el procedimiento estadístico binario CART
Trabajo Original:
Evaluación de la densidad mineral ósea y de los parámetros de 3D-Shaper en la hipofosfatasia congénita del adulto
Revisión:
Acción de la vitamina K sobre la salud ósea
Trabajo Original:
Evolución de la DMO durante el tratamiento con inhibidores de aromatasa y su relación con el gen CYP11A1: estudio prospectivo de la cohorte B-ABLE
Revisión:
Dislipemia y metabolismo óseo. ¿Un vínculo común de la osteoporosis y la aterosclerosis?
Editorial:
El dilema de la deficiencia en vitamina D en regiones soleadas, en jóvenes, o en pacientes osteoporóticas tratadas con vitamina D, podría explicarse por variantes genéticas comunes. ¿Hemos encontrado la piedra Rosetta de esta aparente contradicción?
Trabajo Original:
Estudio estructural mediante micro-CT en fémur de ratas Goto-Kakizaki, modelo experimental de diabetes tipo 2 sin sobrepeso
Carta Director:
Evolución de la densidad mineral ósea tras una intervención de 15 años basada en el entrenamiento de fuerza progresivo
Trabajo Original:
Puntos de cribado de un densitómetro periférico de calcáneo para el diagnóstico de osteoporosis
Trabajo Original:
Prevalencia de osteoporosis en pacientes con síndrome coronario agudo
Revisión:
Estudios de asociación de genoma completo (GWAS) versus validación funcional: reto de la era post-GWAS
Núria Martínez-Gil , Juan David Patiño-Salazar , Raquel Rabionet , Daniel Grinberg , Susana Balcells
Trabajo Original:
Asociación de la gamma glutamil transferasa con la presencia y progresión de calcificaciones aórticas abdominales y con cambios en densidad mineral ósea
Beatriz Martín Carro , Carlos Gómez Alonso , Minerva Rodríguez García , Noelia Avello Llano , Carmen García Gil-Albert , Lucía Sobrino Díaz , Francisco Baena Huerta , Carmen Palomo Antequera , Laura Naves Mendívil , Javier Rodríguez Carrio , José Luis Fernández Martín , Manuel Naves Díaz